COVID-19:变体具有很强的细胞结合力:“ Fugaku”分析

看来人细胞的受体(橙色)和刺突蛋白的“受体结合域(RBD)”是联系在一起的。红色部分是“ E484K}的突变(由立教大学,望月优二实验室提供)

COVID-19:变体具有很强的细胞结合力:“ Fugaku”分析

超级计算机“ Fugaku”分析:

使用RIKEN超级计算机“ Fugaku”进行仿真。

突变菌株的传染性:

新冠状病毒的突变株
结合人类细胞的力量
我发现了一种比常规股票更强大的机制。
立教大学的研究小组于4月28日宣布。

阐明感染机理:

“突变对感染的机制有什么样的影响?”在分子水平上得到了阐明。

有望在将来用于疫苗和治疗剂的研究。

比较变体的传染性:

英国股市1.03倍,
南非和巴西的股票为1.20倍,
文凭:

Peplomer由1300个氨基酸组成。

刺突蛋白的一部分称为“受体结合域(RBD)”。

感染始于“ RBD与细胞表面受体的结合”。

突变会增加传染性:

在英国,南非和巴西菌株中出现了“取代RBD中某些氨基酸的突变”。

这似乎是传染性增加的原因。

研究小组分析:

分析“ RBD与受体的所有氨基酸之间”结合力的大小和类型。

通过仿真再现“它们如何由于突变而改变”。

仿真分析结果:

整合结果并评估“ RBD和受体结合的强度”。

与常规库存相比
英国股市1.03倍,
南非和巴西的股票为1.20倍,
发现受体的结合力增强。

由于突变,加号和减号被颠倒了:

例如,据称具有强传染性的南非毒株具有称为“ E484K”的突变。

这是,

结果表明,豌豆蛋白的第484个氨基酸“谷氨酸(E)”被“赖氨酸(K)”代替。

谷氨酸带负电。另一方面,蓖麻毒蛋白是一个加号。

最初,“与细胞侧带正电荷的氨基酸稳定结合的力”减弱了,相反,它开始被排斥。

另一方面,发生了“通过吸引到细胞侧的负部而使结合力增强的现象”。

未来研究:

这次,我们分析了与细胞受体的相互作用。

在突变应变模型的模拟中,获得了结合力得到增强的结果。

这将导致进行研究以为将来的突变风险做准备。

立教大学的望月裕二教授:

充分利用“富国”的强大计算能力
您现在可以分析互动,
做出在实验中无法获得的预测成为可能。
将来,它可用于研究疫苗和药物作用的研究。

产经新闻

https://www.sankei.com/life/news/210428/lif2104280030-n1.html